Izvestiya of Saratov University.
ISSN 1817-3020 (Print)
ISSN 2542-193X (Online)


молекулярное моделирование

Polymorphism manifestations and aqueous environment influence on the physico-chemical properties of modified succinic acid

Background and Objectives: Succinic acid is widely used in medicine, in particular, in the treatment of cardiological, neurological and endocrinological diseases. An urgent task of pharmacology is to increase the degree of bioavailability and solubility of drugs. One of ways to increase the therapeutic effect of drugs is the development of their polymorphic modifications, which contribute to a more pronounced therapeutic effect.

ПРОЯВЛЕНИЯ ПОЛИМОРФИЗМА И ВЛИЯНИЕ ВОДНОГО ОКРУЖЕНИЯ НА ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА МОДИФИЦИРОВАННОЙ ЯНТАРНОЙ КИСЛОТЫ

На основании комплексного подхода (эксперимент, теория) исследованы спектральные проявления полиморфизма модифицированной янтарной кислоты и влияния водного окружения на ее энергетические характеристики. В области 600-4000 см-1 измерены ИК спектры янтарной кислоты. Методом теории функционала плотности рассчитаны и структуры конформеров изолированной молекулы и фрагмента цепочечного ассоциата янтарной кислоты и их комплексов с водой. Рассчитаны их ИК спектры и проведено сравнение с экспериментальными данными.

Spectral manifestations of amino acids from immunoglobulin and tumor necrosis factor composition intermolecular interaction and effect of cyanine 7 on this interaction

Immunoglobulin and tumor necrosis factor complex formation, which is the basis of immunosuppressive drug etanercept therapeutic action, has been studied using quantum chemical modeling and molecular dynamics. The effect on the possibility of cyanine 7 on hydrogen bonds formation between amino acids from tumor necrosis factor and immunoglobulin has been considered.

СПЕКТРАЛЬНЫЕ ПРОЯВЛЕНИЯ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ АМИНОКИСЛОТ ИЗ СОСТАВА ИММУНОГЛОБУЛИНА И ФАКТОРА НЕКРОЗА ОПУХОЛИ И АНАЛИЗ ВЛИЯНИЯ ЦИАНИНА 7 НА ЭТО ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Методами квантовохимического моделирования и молекулярной динамики исследовано комплексообразование иммуноглобулина и фактора некроза опухоли, взаимодействие которых составляет основу терапевтического действия иммунодепрессивного препарата этанерцепт. Было рассмотрено влияние красителя цианин 7 на возможности образования водородных связей между аминокислотами фактора некроза опухоли и иммуноглобулина.

Mechanisms of intermolecular interaction of mitoxantrone with targeted delivery polyelectrolyte capsules

Background and Objectives: Polyelectrolyte capsules are one of the most promising materials for targeted drug delivery – one of the rapidly developing areas of modern chemistry, pharmacology and medicine. They have a wide range of applications due to various methods of controlling their physical and chemical properties.

МЕХАНИЗМЫ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МИТОКСАНТРОНА С ПОЛИЭЛЕКТРОЛИТНЫМИ КАПСУЛАМИ АДРЕСНОЙ ДОСТАВКИ

Методами квантовохимического моделирования на основе теории функционала плотности исследуются механизмы межмолекулярного взаимодействия высокотоксичных лекарственных препаратов с веществами полиэлектролитных капсул адресной доставки. В качестве исследуемых объектов рассматриваются противоопухолевый лекарственный препарат митоксантрон и полимерные полиэлектролитные капсулы, состоящие из полиаргинина и декстран сульфата. Моделирование проводилось на основе расчета молекулярных структур и ИК спектров и анализа параметров образующихся водородных связей.

ВОЗМОЖНОСТИ МЕЖМОЛЕКУЛЯРНОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ПОЛИЭЛЕКТРОЛИТНЫХ КАПСУЛ С МИТОКСАНТРОНОМ

Методами квантовохимического моделирования исследуются молекулярные механизмы межмолекулярного взаимодействия полиэлектролитных капсул с лекарственными препаратами. С развитием нанотехнологий появились способы капсулирования лекарств, т.е. загрузка лекарств в контейнеры, среди которых многослойные полиэлектролитные капсулы, получаемые методом послойной адсорбции макромолекул с функциональными группами, способными к электрической диссоциации.

Investigation of the influence of the hydrogen bonding on the structure and vibrational spectra of biphenylmethanols

Using density functional method (B3LYP/6-31G*), the structures of the biphenylmethanols, their h-bond complexes and methanol h-bond complexes, energies, dipole moments, polarizabilities, frequencies of normal vibrations (in harmonic approximation) and their intensities in vibrational spectra were simulated.

IR Spectra of Cyclohexanol, Structural-Dynamic Models of Molecule

In wide temperature range IR spectra of cyclohexanol in different phase state (plastic phase, crystal phases II, III) have been measured in range 600–3600 см–1. Using density functional method B3LYP/6-31G structural – dynamic models of conformers of cyclohexanol molecule, which differs from each other by orientation of hydroxyl group relatively carbonic ring and cyclohexan, have been constructed. The energy, structure, dipole moments, polarizabilities and the frequencies of the normal modes in harmonic approximation and IR intensities have been calculated.

Hydrogen Bonding and its Influence on the Structure and Vibrational Spectra of Cyclohexanol

In the range of 600–3600 cm–1 in a wide range of temperatures, in different phase states (plastic phase I, the crystalline phase II and III) IR spectra of cyclohexanol have been measured. Using method of density functional theory (B3LYP) in the basis of 6-31G (d) the structural-dynamic models of conformers of cyclohexanol molecules differing from each other by orientation of hydroxyl group relatively carbonic ring and H-complexes with different structures, which presumably realized in polymorphic modification of cyclohexanol, have been constructed.

Pages