Izvestiya of Saratov University.

Physics

ISSN 1817-3020 (Print)
ISSN 2542-193X (Online)


For citation:

El’kin P. M., Pulin V. F., Berezin V. I. System’s Analysis of Vibrational Spectra in Dimmers of 5X-Substituted Uracile. Izvestiya of Sarat. Univ. Physics. , 2013, vol. 13, iss. 2, pp. 39-45. DOI: 10.18500/1817-3020-2013-13-2-39-45

This is an open access article distributed under the terms of Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC-BY 4.0).
Full text:
(downloads: 49)
Language: 
Russian
Heading: 
UDC: 
539.193/.194;535/.33/34

System’s Analysis of Vibrational Spectra in Dimmers of 5X-Substituted Uracile

Autors: 
El’kin Pavel Mikhailovich, Engels Technological Institute (affiliated branch) of Saratov State Technical University
Pulin Viktor Fedotovich, Saratov State Agrarian University named after N.I. Vavilov
Berezin Valentine Ivanovich, Saratov State University
Abstract: 

On based of method DFT/b3LYP for parameters of adiabatic potential for the substituted 5X-uraciles (X = CH3, NH2, F, Cl) the theory of characteristic vibration for monomers and dimmers for the regarded class biomolecules are constructed. The indications of spectral identification for dimmers with strong hydrogen bonds are revealed.

Reference: 
  1. Dobrowolski J. Cz., Rode J. E., Kobos R., Jamroz M., Bajdor K., Mazurik A. R. Ar-matrix IR spectra of 5-halogenuracil interpreted by DFT calculation // J. Phys. Chem. A 2005. Vol. 109. P. 2167–2182.
  2. Zhi-Guo Shang, Dor N. T., Wong Y. T., Tan Y. C., Ying B., Mo Y. J. A study of DFT and surface enhanced Raman scattering in silver colloids for thymine // J. Mol. Structure. 2007. Vol. 826. P. 64–67.
  3. Rastogi V. K., Palafox N. A., Guerrero-Martinez A., Tardajos G., Valts J. K., Kostova I., Shlukcer S., Kiefer W. FT-IR and Raman spectra, ab initio and density functional computations of the vibrational spectra, molecular geometry, atomic charges and some molecular properties of biomolecule 5-iodouracil // J. Mol. Structure. 2010. Vol. 940. P. 29–44.
  4. Prasad O., Sinha L., Kumar N. Theretical Raman and IR spectra of tegafur and comparison of molecular electrostatic potential surface, polarizability and hyer polarizability of tegafur with 5-fl uoro-uracil by density functional theory // J. At. Mol. Sci. 2010. Vol. 1, № 3. P. 201–214.
  5. Singh J. S. Rtir and Raman spectra and fundamental frequencies of 5-halosubstituted uracils // Specrtochim. Acta. 2012. Vol. 87A, № 2. P. 106–111.
  6. Sing J. S. Laser Raman and infra-red spectra of biomolecules : 5-aminouracil // Pram. J. of Physics. 2008. Vol. 70, № 3. P. 479–486.
  7. Элькин М. Д., Джалмухамбетова Е. А., Гречухина О. Н. Проявление межмолекулярного взаимодействия в димерах урацила // Изв. Сарат. ун-та. Нов. cер. Сер. Физика. 2008. Т. 8, вып. 2. С. 25–29.
  8. Эрман Е. А., Элькин М. Д., Равчеева Н. А., Лихтер А. М., Джалмухамбетова Е. А., Алыкова О. М. Структурно-динамические модели и колебательные спектры димеров хлорурацила // Естественные науки. 2012. № 2(39). С. 220–226.
  9. Элькин П. М., Эрман М. А., Карташов В. М. Математическое моделирование структуры и динамики димеров урацила и азаурацилов // Изв. Волгоград. гос. техн. ун-та. 2012. № 10(97). С. 55–62. 
  10. Эрман Е. А., Элькин П. М., Смирнов А. П. Математические модели и компьютерные технологии в молекулярном моделировании // Прикаспийский журнал : управление и высокие технологии. 2010. № 3(18). С. 126–130.
  11. Элькин М. Д., Пулин В. Ф., Осин А. Б. Математические модели в молекулярном моделировании // Изв. Сарат. гос. техн. ун-та. 2010. № 4(49). С. 36–39.
  12. Элькин М.Д., Бабков Л.М. Учет ангармонического смещения полос в модельных расчетах колебательных спектров димеров с водородной связью // Изв. Сарат. ун-та. Нов. сер. Сер. Физика. 2011. Т. 11, вып. 1. С. 20–25.
  13. Пулин В. Ф., Элькин М. Д., Березин В. И. Исследование динамики молекулярных соединений различных классов. Саратов : Изд-во Сарат. гос. техн. ун-та, 2002. 436 с.
  14. Frisch M. J., Trucks G. W., Schlegel H. B. et al. Gaussian 03. Revision B.03 / Gaussian Inc. Pittsburgh, 2003. 302 p.