Известия Саратовского университета.

Новая серия. Серия Физика

ISSN 1817-3020 (Print)
ISSN 2542-193X (Online)

Для цитирования:

Бурова Т. Г., Тен Г. Н. Исследование оснований нуклеиновых кислот методами спектроскопии резонансного комбинационного рассеяния // Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Физика. 2007. Т. 7, вып. 2. С. 3-29. DOI: 10.18500/1817-3020-2007-7-2-3-29

Статья опубликована на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC-BY 4.0).
Опубликована онлайн: 
28.12.2007
Полный текст в формате PDF(Ru):
скачать
(загрузок: 214)
Язык публикации: 
русский
Рубрика: 
Физика
Тип статьи: 
Научная статья
УДК: 
535.375
DOI: 
10.18500/1817-3020-2007-7-2-3-29

Исследование оснований нуклеиновых кислот методами спектроскопии резонансного комбинационного рассеяния

Авторы: 
Бурова Татьяна Геннадиевна, Саратовский национальный исследовательский государственный университет имени Н. Г. Чернышевского
Тен Галина Николаевна, Саратовский национальный исследовательский государственный университет имени Н. Г. Чернышевского
Аннотация: 

Изложены элементы теории и квантово-механического метода расчета распределения интенсивностей в спектрах РКР сложных молекул и обсуждены результаты их применения для описания спектров резонансного комбинационного рассеяния молекул аденина, пурина, гуанина, урацила, тимина и цитозина.

Ключевые слова: 
нуклеиновые кислоты
спектры резонансного комбинационного рассеяния
Список источников: 
  1. Приютов М.В., Бурова Т.Г. Эффект Герцберга−Теллера и распределение интенсивности в спектрах РКР многоатомных молекул // Опт. и спектр. 1988. Т.64, вып.1. С.182−185.
  2. Бурова Т.Г. Влияние эффекта Герцберга−Теллера на распределение интенсивности в спектрах РКР и двухфотонного поглощения многоатомных молекул // Хим. физика. 1994. Т.13, №3. С.29−35.
  3. Берестецкий В.Б., Лифшиц Е.М., Питаевский Л.П. Релятивистская квантовая теория. М., 1968. Ч.1.
  4. Брандмюллер И., Мозер Г. Введение в спектроскопию комбинационного рассеяния света. М.. 1964.
  5. Сущинский М.М. Спектры комбинационного рассеяния молекул и кристаллов. М., 1969.
  6. Ковнер М.А., Приютов М.В. Явный учет электронноколебательного взаимодействия при расчете интенсивностей полос колебательной структуры спектров поглощения бензола и замещенных бензола // Докл. АН СССР. 1972. Т.204, №3. С.397−402.
  7. Баранов В.И., Грибов Л.А. Расчеты электронноколебательных спектров многоатомных молекул в франккондоновском и герцберг-теллеровском приближениях // Опт. и спектр. 1979. Т.47, вып.1. С.91−99.
  8. Бурова Т.Г., Приютов М.В. Расчет матричных элементов функции Грина многомерного осциллятора с учетом эффекта Душинского // Журн. прикл. спектр. 1991. Т.54, №5. С.91.
  9. Бурова Т.Г., Гурьев К.И. Применение метода функции Грина при описании распределения интенсивности в спектрах РКР многоатомных молекул // Спектроскопия и физика молекул. Саратов, 1996. С.6−8.
  10. Преэм Р.А. О вычислении сумм в теории комбинационного рассеяния в приближении гармонического осциллятора // Тр. ИФА АН ЭССР. 1964. №25. С.47−61.
  11. Бурова Т.Г. Эффект Герцберга−Теллера и распределение интенсивности в спектрах поглощения и РКР многоатомных молекул // Журн. структур. химии. 1995. Т.36, №3−4. С.304−309.
  12. Бурова Т.Г. Расчет интенсивности в спектрах РКР и ДФП многоатомных молекул // Журн. структур. химии. 1997. Т.38, №2. С.248−255.
  13. Бурова Т.Г., Тен Г.Н., Березин В.И. Квантовомеханический расчет спектров резонансного комбинационного рассеяния аденина // Опт. и спектр. 1999. Т.86, №3. С.397−402.
  14. Грибов Л.А., Дементьев В.А. Методы и алгоритмы вычислений в теории колебательных спектров многоатомных молекул. М., 1981.
  15. Тен Г.Н., Нечаев В.В., Березин В.И., Баранов В.И. Расчет нормальных колебаний аденина и его замещенных // Журн. структур. химии. 1997. Т.38, №2. С.324−333.
  16. Тен Г.Н., Нечаев В.В., Березин В.И., Баранов В.И. Расчет электронно-колебательных спектров молекулы аденина // Журн. структур. химии. 1997. Т.38, №2. С.333−344.
  17. Blazej D., Peticolas W.L. Ultraviolet resonance Raman spectroscopy of nucleic acid components // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1977. V.74, №7. P.2639−2643.
  18. Majoube M., Millie Ph., Lagant P., Vergoten G. Resonance Raman enhancement for adenine and guanine residues // J. Raman Spectr. 1994. V.25. P.821−836.
  19. Toyama A., Hanada N., Abe Y., Takeuchi H., Harada I. Assignment of adenine ring in-plane vibrations in adenosine on the bases of 15N and 13C isotopic frequency and UV resonance Raman enhancement // J. Raman Spectr. 1994. V.25. P.623−630.
  20. Dhaouadi Z., Ghomi M., Austin J., Girling R., Hester R., Mojzes P., Chinsky L., Turpin P., Coulombeau C., Jobic H., Tomkinson J. Vibration motions of bases of nucleic acids as revealed by neutron inelastic scattering and resonance Raman spectroscopy // J. Phys. Chem. 1993. V.97, №5. P.1074−1084. Физика 29 Т.Г. Бурова, Г.Н. Тен. Исследование оснований нуклеиновых кислот
  21. Lee S., Chang H. Missing mode effect in resonance Raman excitation profile // J. Chem. Phys. 1994. V.100, №6. P.4056−4066.
  22. Nishimura Y., Tsuboi M., Kubasek W., Bajdor K., Peticolas W. Ultraviolet resonance Raman bands of guanosine and adenosine residues useful for the determination of nucleic acid conformation // J. Raman Spectr. 1987. V.18. P.221−227.
  23. Kubasek W., Hudson B., Peticolas W. Ultraviolet resonance Raman excitation profiles of nucleic acid bases with excitation from 200 to 300 nm // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1985. V.82. P.2369−2374.
  24. Toyama A., Takeuchi H., Harada I. Ultraviolet resonance Raman spectra of adenine, uracil and thymine derivatives in several solvents // J. Mol. Struct. 1991. V.242. P.87−98.
  25. Попов Е.М., Коган Г.А. Учет корреляции между длинами, силовыми постоянными и порядками связей // Успехи химии. 1968. №37. С.256−295.
  26. Majoube M., Millie Ph., Chinsky L., Turpin P., Vergoten G. Resonance Raman spectra of purene // J. Mol. Struct. 1995. V.335. P.147−158.
  27. Lipinsky J. Properties of 2’,3’-dideoxy-2’3’-dehydrothymine 5’triphosphate in terminating DNA synthesis // Spectrochim. Acta. 1989. V.45A, №5. P.557−559.
  28. Бурова Т.Г., Тен Г.Н., Кучерова В.В. Теоретическое исследование электронно-колебательных спектров парадигалоидобензолов // Моделирование процессов в радиофизических и оптических устройствах. Саратов, 2003. С.5−7.
  29. Fodor S., Rava R., Hays T., Spiro T. Ultraviolet resonance Raman spectroscopy of the nucleotides with 266-, 240-, 218- and 200 nm pulsed laser excitation // J. Amer. Chem. Soc. 1985. V.107. P.1520−1529.
  30. Nir E., Jansen Ch., Kleinermanns K., Vries M. Guanine tautomerism revealed by UV-UV and IR-UV hole burning spectroscopy // J. Chem. Phys. 2001. V.115, №10. P.4604−4611.
  31. Mennucci B., Toniolo A., Tomasi J. Theoretical study of guanine from gas phase to aqueous solution // J. Phys. Chem. 2001. V.105A. P.7126−7134.
  32. Tian S., Xu K. A density functional approach of proto tropic tautomerism of guanine // Chem. Phys. 2001. V.264. P.187−196.
  33. Toyama A., Fujimoto N., Hanada N., Ono J., Yoshimitsu E., Vatsubuchi A., Takeuchi H. Assignments and hydrogen bond sensitivities of UV resonance Raman bands of the C8- deuterated guanine ring // J. Raman Spectr. 2002. V.33. P.699−708.
  34. Toyama A., Hanada N., Ono J., Yoshimitsu E., Takeuchi H. // J. Raman Spectr. 1999. V.30. P.623−630.
  35. Chin S., Scott I., Szczepaniak K., Person W. Matrix isolation studies of nucleic acid constituents // J. Amer. Chem. Soc. 1984. V.106, №12. P.3415−3422.
  36. Тен Г.Н., Бурова Т.Г. Анализ нормальных колебаний пурина // Актуальные вопросы научных исследований. Вып.3, ч.2. Теоретическая и прикладная спектроскопия. Саратов, 1998. С.5−11.
  37. Rush III, Peticolas W. Ab initio calculations of resonance Raman spectra of uracil, 1-methyluracil and 5-methyl-uracil // J. Phys. Chem. 1995. V.99, №40. P.14647−14658.
  38. Ghomi M., Letellier R., Taillander E., Chinsky L., Laigle A., Turpin P. Interpretation of the vibrational modes of uracil and its 18O-substituted and thio derivatives studed by resonance Raman spectroscopy // J. Raman Spectr. 1986. V.17. P.249−255.
  39. Chinsky L., Hubert-Habart M., Laigle A., Turpin P. Carbonyl stretching vibrations of uracil studied by 18O isotopic substitutions with UV resonance Raman spectroscopy // J. Raman Spectr. 1983. V.14. P.322−325.
  40. Peticolas W., Rush III. Ab initio calculations of the ultraviolet resonance Raman spectra of uracil // J. Comp. Chem. 1995. V.16. P.1261−1270.
  41. Peticolas W., Strommen D., Lakshminarayanan V. The use of resonant Raman intensities in refining molecular force fields for Wilson G-F calculations and obtaining excited state molecular geometry // J. Chem. Phys. 1980. V.73. P.4185−4191.
  42. Peticolas W., Blazej D. Estimation of the distortion of the geometry of nucleic acid bases in the excited electronic state from the ultraviolet resonance Raman intensity of certain normal modes // Chem. Phys. Lett. 1979. V.63. P.604−610.
  43. Tsuboi M., Takahashi S., Harada I. Physico-Chemical Properties of Nucleic Acids. N.Y., 1973. P.91−145.
  44. Тен Г.Н., Бурова Т.Г. Анализ плоских колебаний тимина // Проблемы оптической физики, Саратов, 2002. С.94−96.
  45. Clark L.B., Tinoco I. Correlations in the ultraviolet spectra of the purene and pyrimidine bases // J. Amer. Chem. Soc. 1965. V.87. P.11−20.
  46. Susi H., Ard J.S. Vibrational spectra of nucleic acid constituens. Planar vibrations of uracil // Spectrochim. Acta. 1971. 27A. P.1549−1562.
  47. Podolyan Y., Rubin Y., Leszczynski J. An ab initio PostHartree-Fock comparative study of 5-azacytosine and cytosine // J. Phys. Chem. 2000A. V.104. P.9964−9970.
  48. Shukla M., Mishra P. A gas phase ab initio excited state geometry optimization study of thymine, cytosine and uracil // Chem. Phys. 1999. V.240. P.319−329.
  49. Spiro T., Wiley E. Biological application of Raman Spectroscopy // Resonance Raman Spectr. N.Y., 1987. V.2. P.149−159.
Поступила в редакцию: 
20.07.2007
Принята к публикации: 
12.11.2007
Опубликована: 
28.12.2007
  • 1276 просмотров